Larawan sa pamamagitan ng Michal Ico / Unsplash
Ang artikulong ito ni Alexandre Hassanin ay muling nai-publish dito na may pahintulot mula sa Ang pag-uusap . Ang nilalaman na ito ay ibinabahagi dito dahil maaaring mapainteres ng paksa ang mga mambabasa ng Snope na hindi nito, kinakatawan ang gawain ng mga Snope fact-checker o editor.
Sa loob ng ilang linggo, marami tayong natutunan tungkol sa COVID-19 at ang virus na sanhi nito: SARS-CoV-2. Ngunit marami na ring tsismis. At habang ang bilang ng mga pang-agham na artikulo sa virus na ito ay dumarami, marami pa ring mga kulay-abo na lugar sa mga pinagmulan nito.
Saang mga species ng hayop ito naganap? Isang paniki, isang pangolin o ibang ligaw na species? Saan ito nagmula? Mula sa isang yungib o isang kagubatan sa probinsya ng Hubei ng Tsina, o saanman?
Noong Disyembre 2019, 27 sa unang 41 katao na naospital (66%) ang dumaan sa isang merkado na matatagpuan sa gitna ng lungsod ng Wuhan sa lalawigan ng Hubei. Ngunit, ayon sa a pag-aaral na isinagawa sa Wuhan Hospital , ang pinakaunang kaso ng tao na natukoy ay hindi madalas sa merkado na ito. Sa halip, isang pagtatantya ng molekular na pakikipag-date batay sa mga pagkakasunud-sunod ng genomic ng SARS-CoV-2 nagpapahiwatig ng pinagmulan noong Nobyembre. Nagtataas ito ng mga katanungan tungkol sa ugnayan sa pagitan ng COVID-19 na epidemya at wildlife.
Data ng genomic
Ang SARS-CoV-2 genome ay mabilis na sumunud-sunod ng mga mananaliksik na Intsik. Ito ay isang RNA Molekyul ng humigit-kumulang na 30,000 na mga base na naglalaman ng 15 mga gene, kasama ang S gene na mga code para sa isang protina na matatagpuan sa ibabaw ng viral envelope (para sa paghahambing, ang aming genome ay nasa anyo ng isang dobleng helix ng DNA tungkol sa 3 bilyong mga base sa laki at naglalaman ng mga 30,000 gen).
Pahambing pagsusuri ng genomic ipinakita na ang SARS-CoV-2 ay kabilang sa pangkat ng Mga Betacoronavirus at na ito ay napakalapit sa SARS-CoV , responsable para sa isang epidemya ng talamak na pulmonya na lumitaw noong Nobyembre 2002 sa lalawigan ng Tsina ng Guangdong at pagkatapos ay kumalat sa 29 na mga bansa noong 2003. Isang kabuuang 8,098 na mga kaso ang naitala, kabilang ang 774 na pagkamatay. Alam na ang mga paniki ng genus Rhinolophus (potensyal na maraming mga species ng yungib) ay ang reservoir ng virus na ito at iyon ay isang maliit na carnivore, ang palad na civet ( Paguma larvata ), maaaring nagsilbi bilang isang tagapamagitan host sa pagitan ng mga paniki at sa mga unang kaso ng tao.
Simula noon, marami Mga Betacoronavirus natuklasan, pangunahin sa mga paniki, ngunit din sa mga tao. Halimbawa, ang RaTG13, na nakahiwalay sa isang paniki ng species Kaugnay ng Rhinolophidae na nakolekta sa Lalawigan ng Yunan ng Tsina, kamakailan ay inilarawan na halos kapareho sa SARS-CoV-2, na may ang mga pagkakasunud-sunod ng genome ay magkapareho sa 96% . Ipinapahiwatig ng mga resulta na ang mga paniki, at sa partikular na mga species ng genus Rhinolophus , bumubuo sa reservoir ng mga virus ng SARS-CoV at SARS-CoV-2.
Isa, Kaugnay ng Rhinolophidae .
Alexandre Hassanin,Nagbigay ng may akda
Ngunit paano mo tinutukoy ang isang reservoir? Ang isang reservoir ay isa o maraming mga species ng hayop na hindi o hindi masyadong sensitibo sa virus, na natural na magho-host ng isa o maraming mga virus. Ang kawalan ng mga sintomas ng sakit ay ipinaliwanag ng pagiging epektibo ng kanilang immune system, na nagbibigay-daan sa kanila upang labanan laban sa sobrang paglaganap ng viral.
Mekanismo ng muling pagsasama
Noong Pebrero 7, 2020, nalaman namin na ang isang virus na mas malapit pa sa SARS-CoV-2 ay natuklasan sa pangolin. Na may 99% ng iniulat ang genomic concordance , iminungkahi nito ang isang mas malamang na reservoir kaysa sa mga paniki. Gayunpaman, a kasalukuyang pag-aaral na sinusuri ipinapakita na ang genome ng coronavirus na ihiwalay mula sa pangolin ng Malaysia ( Manis javanica ) ay hindi gaanong katulad sa SARS-Cov-2, na may 90% lamang ng genomic concordance. Ipinapahiwatig nito na ang virus na nakahiwalay sa pangolin ay hindi responsable para sa COVID-19 epidemya na kasalukuyang nagngangalit.
Gayunpaman, ang coronavirus na nakahiwalay mula sa pangolin ay pareho sa 99% sa isang tukoy na rehiyon ng S protein, na tumutugma sa 74 mga amino acid na kasangkot sa ACE (Angiotensin Converting Enzyme 2) receptor binding domain, ang isa na nagpapahintulot sa virus na pumasok mga cell ng tao upang mahawahan ang mga ito. Sa kaibahan, ang virus na RaTG13 ay nakahiwalay sa paniki May kaugnayan si R. ay lubos na magkakaiba sa tukoy na rehiyon na ito (77% lamang ng pagkakapareho). Nangangahulugan ito na ang coronavirus na nakahiwalay sa pangolin ay may kakayahang makapasok sa mga cell ng tao samantalang ang isang ihiwalay sa paniki May kaugnayan si R. ay hindi.
Bilang karagdagan, iminumungkahi ng mga paghahambing na genomic na ang SARS-Cov-2 na virus ay resulta ng isang pagsasama-sama sa pagitan ng dalawang magkakaibang mga virus, ang isang malapit sa RaTG13 at ang iba pang malapit sa pangolin virus. Sa madaling salita, ito ay isang chimera sa pagitan ng dalawang paunang mayroon nang mga virus.
Ang isang coronavirus mula sa pangolin ay maaaring maging isa sa mga mapagkukunan para sa COVID-19.
Wildlife Alliance / Flickr , CC NI
Ang mekanismo ng muling pagsasama na ito ay nagkaroon nailarawan na sa coronavirus, partikular na upang ipaliwanag ang pinagmulan ng SARS-CoV. Mahalagang malaman na ang pagsasama-sama ay nagreresulta sa isang bagong virus na potensyal na may kakayahang mahawahan ang isang bagong host species. Upang maganap ang muling pagsasama, ang dalawang magkakaibang mga virus ay dapat na nahawa sa parehong organismo nang sabay-sabay.
Dalawang katanungan ang mananatiling hindi nasasagot: saang organismo naganap ang muling pagsasama na ito? (isang paniki, isang pangolin o ibang species?) At higit sa lahat, sa ilalim ng anong mga kondisyon naganap ang muling pagsasama na ito? 
Alexandre Hassanin , Associate Professor (HDR) sa Sorbonne University, ISYEB - Institute of Systematics, Evolution, Biodiversity (CNRS, MNHN, SU, EPHE, UA), Pambansang Museo ng Likas na Kasaysayan (MNHN)
Ang artikulong ito ay muling nai-publish mula sa Ang pag-uusap sa ilalim ng isang lisensya ng Creative Commons. Basahin ang orihinal na artikulo .
